化学系于1928年建立,1979年恢复建立。近年来，在国家“ 211 ”和“ 985 ”的大力支持下，发扬“与时俱进”的精神和“立足上海，服务全国、面向世界”的办学特色，化学系获得了长足的发展，到目前，已拥有应用化学和高分子化学与物理两个博士点，无机化学、有机化学、分析化学和物理化学四个硕士点。
化学系下设无机与分析化学、有机化学、物理化学和大学化学四个教研室和基础化学实验中心。拥有 11514 m2 建筑面积的实验大楼和逾 2500 万元的仪器设备，为教学与科学研究提供了优越的实验条件和基地。除购彩大厅 的本科教学外，化学系还承担着大量的全校化学近源专业的基础化学及实验的教学任务和化学远源专业的大学化学及实验的教学任务。化学系的四大基础化学课程以及大学化学和实验化学课程均为学校的一类课程，其中大学化学和有机化学两门课程分别于2003 及 2004 年荣获上海市“精品课程”称号。
科学研究以基础研究为主要方向，与国民经济特别是支柱产业密切结合，达到服务社会的目的。承担了许多项国家重点攻关项目、国家自然科学基金项目、国家“ 863 ”和“ 973 ”项目、上海市星火计划项目和产业攻关项目，以及大量企业委托项目，取得了丰硕的业绩。从事科研的主要领域有：新型手性纳米介孔材料、纳米材料以及有机－无机纳米复合材料，配位化学与超分子化学、毛细管电泳及微流控芯片分析，环境分析化学、化学键中的相对论效应与密度泛涵理论，含氟自由基化学、通用分子力场模型、酶抑制剂药理及计算机辅助设计，高效不对称催化、金属有机化学，药物有机化学 染料化学与光电功能材料。
雄厚的师资力量和活跃的学术思想，以及先进的实验手段和仪器设备，使化学系科技成果丰硕、科技水平日益攀升、国际交往广泛。近年来，同美国、加拿大、日本、德国、英国、荷兰等国家著名大学的科研和教学合作不断增加，化学系的国内、国际影响和声望正随之不断提高。
